海盗活动被认为是影响马六甲航运安全的一大因素。1998年马六甲海盗活动快速增加的主要原因是1997年的东南亚金融危机，而2004年以后减少的主要原因是针对马六甲海盗活动建立起了一整套应对机制。马六甲海盗作案的目的主要是为了钱财而非出于政治目的。现有的反海盗措施是有效的，马六甲海盗活动已得到有效控制，海盗活动反弹的可能性不大。在沿岸国领海以外水域中发生的案件，各国都有权进行管制。中国船只受袭击的情况不常见，但在马六甲海峡与新加坡海峡的安全管理上中国应加大参与力度。